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Event Type: CURSO
Event Period: Jun 8, 2020 a Aug 10, 2020 (Evento encerrado)
About:

Seja bem vindo!

O curso "Visualização e análise de redes de interação proteína-proteína com o programa Cytoscape" é teórico/prático, assíncrono que, após apresentação do conteúdo em formato de arquivo, o participante poderá praticar livremente, inclusive fora do horário programado para o curso.

Durante o curso o participante terá oportunidade de conhecer sobre as aplicações de redes de interação proteína-proteína (RIP) bem como alguns bancos de dados que disponibilizam publicamente dados de interações. Terá oportunidade de utilizar o programa Cytoscape para visualizar e analisar as RIPs visando calcular propriedades topológicas como o grau de interação, proteínas hubs, cluster e sub-redes. Após o treinamento com conjunto de dados didático, o participante poderá selecionar um organismo de seu interesse para gerar as RIPs e fazer as análises livremente.

Requisitos: Para o curso o participante deverá possuir um PC com sistema operacional Linux ou Windows

O presente curso têm por objetivo auxiliar os discentes  no entendimento básicos sobre a geração e analise de redes de interação proteína-proteína (RIP), disponíveis em bases de dados pública, com uso do programa Cytocape:

- Conhecer as aplicações para as RIPs;

- Compreender o conteúdo de bancos dados públicos de interação proteína-proteína;

- Conhecer,  recuperar e preparar as interações da base de dados pública STRING;

- Carregar, visualizar e analisar RIPs no programa Cytoscape;

- Analisar as RIPs visando calcular propriedades topológicas como o grau de interação, proteínas hubs, clusters e sub-redes.

Os módulos do curso serão disponibilizados semanalmente em uma plataforma on-line,  devendo participante acessar e ler o conteúdo no horário que for mais conveniente, no entanto, devendo executar as atividades semanalmente.


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